BioJava:CookbookFrench:Fasta:Parser

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Comment lire les résultats d'un fichier de sortie FASTA?

La procédure pour lire les résultats FASTA est très similaire à celle utiliser pour lire les résultats BLAST. En prenant la recette pour le lecteur BLAST, remplacer la ligne suivante:

XMLReader parser = new BlastLikeSAXParser();

par

XMLReader parser = new FastaSearchSAXParser();

Vous avez maintenant un parser FASTA fonctionnel ;-)

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